Comment les ARNm peuvent avoir un impact sur notre génome et donc sur l'ADN (Nature)

La modification de l'ARN m6A comme nouvel acteur dans la régulation de la boucle R
Article originel : m⁶A RNA modification as a new player in R-loop regulation
Par Aline Marnef & Gaëlle Legube
Nature Genetics volume 52, pages27-28(2020), publié le 23 décembre 2019.

ARN : les hybrides d'ADN qui se forment à travers les génomes contrôlent un large éventail de processus biologiques. Une nouvelle étude montre que la modification de la N6-méthyladénosine (m6A) sur les fragments d'ARN régule la formation et l'intégrité du génome de ces hybrides. Cette découverte ouvre une nouvelle voie de recherche sur la façon dont les modifications de l'ARN (l'"épitranscriptome") peuvent aider à contrôler la maintenance du génome.
 

Les R-loops sont des structures tripartites qui se forment par co-transcription, de sorte que l'ARN naissant s'hybride à nouveau avec la matrice d'ADN (ARN:hybride d'ADN), laissant ainsi un ADN simple brin déplacé et non hybridé (Fig. 1). Les boucles R sont fréquentes dans les gènes hautement transcrits et s'accumulent également dans les répétitions telles que les centromères, les télomères et les rétrotransposons. Les boucles R sont bénéfiques pour divers processus biologiques tels que l'initiation et la terminaison de la transcription, la réplication, le maintien des télomères et la recombinaison des classes d'immunoglobulines. Cependant, elles sont également de puissants inducteurs de dommages à l'ADN et d'obstacles à la réparation, agissant ainsi comme une source d'instabilité du génome. Une régulation étroite des niveaux de la boucle R est donc essentielle et est obtenue en empêchant leur formation co-transcriptionnelle et en favorisant leur élimination par des nucléases spécifiques (par exemple, la RNase H) et des hélicases (par exemple, la Sénataxine et la FANCM). Dans ce numéro, Abakir et al. proposent une nouvelle voie de régulation inattendue dans laquelle le dépôt de m6A sur les fragments d'ARN des hybrides ARN:ADN contribue à l'élimination des boucles R4...

m6A est la modification interne la plus abondante de l'ARNm eucaryote. Cette marque épitranscriptomique ajoutée par co-transcription a de multiples rôles dans le métabolisme de l'ARNm, et on s'attend à ce que le m6A soit associé à une grande variété de pathologies. Notamment, l'ARN naissant peut également s'hybrider à la matrice d'ADN, formant ainsi ce que l'on appelle des "R-loops". Abakir et al. proposent que les boucles R sont modifiées par le m6A sur leurs fragments d'ARN. Le lecteur d'ARN m6A YTHDF2 est recruté et déstabilise ensuite les hybrides ARN:ADN par un mécanisme qui reste à déterminer (tel que l'action des nucléases, des hélicases ou de la RNase P). La régulation étroite des niveaux des boucles R est essentielle pour assurer la stabilité du génome ; en conséquence, la stabilisation des boucles R modifiées par le m6A (après épuisement du YTHDF2) augmente la formation de cassures double-brin de l'ADN. Ces résultats étendent les fonctions précédemment reconnues de la voie m6A dans le métabolisme de l'ARN au maintien de l'intégrité du génome et ouvrent des voies vers de nouvelles stratégies thérapeutiques pour les maladies liées aux boucles R.

Lire la suite

Traduction SLT

***
Pour toute question ou remarque merci de nous contacter à l'adresse mail suivante : samlatouch@protonmail.com.

Pour savoir pourquoi nous avons dû changer d'e-mail : cliquez ici.
----

Les articles du blog subissent encore les fourches caudines de la censure cachée via leur déréférencement par des moteurs de recherche tels que Yahoo, Qwant, Bing, Duckduckgo.
- Rapport de l'IRSEM de novembre 2018. Comment l'armée française considère le blog de SLT et ...les autres
- Contrairement à Google, Yahoo & Co boycottent et censurent les articles de SLT en les déréférençant complètement !
- Censure sur SLT : Les moteurs de recherche Yahoo, Bing et Duckduckgo déréférencent la quasi-totalité des articles du blog SLT !