Gains de fonction. Une équipe étatsunienne créée un variant Omicron S hautement pathogène échappant aux vaccins et à fort taux de mortalité

Dans un article en préimpression, une équipe de Boston (notamment de Harvard) aux Etats-Unis  a créée par gain de fonction un variant Omicron beaucoup plus pathologique que le varaint Omicron classique. Il serait responsable, selon cette équipe, d'un fort pouvoir de létalité chez la souris avec un taux de mortalité de 80%. L'explication du mécanisme d'action est détaillée succintement dans le résumé de l'article ci-dessous (caractères mis en gras dans le corps du résumé).

L'article s'intitule : "Role of spike in the pathogenic and antigenic behavior of SARS-CoV-2 BA.1 Omicron" ("Rôle de la proétine de pointe dans le comportement pathogène et antigénique du SARS-CoV-2 BA.1 Omicron)
Da-Yuan Chen, Devin Kenney, Chue-Vin Chin, Alexander H Tavares, Nazimuddin Khan, Hasahn L Conway, GuanQun Liu, Manish C Choudhary, Hans P Gertje, Aoife K OConnell, Darrell N Kotton, Alexandra Herrmann, View ORCID ProfileArmin Ensser, John H Connor, Markus Bosmann, Jonathan Z Li, Michaela U Gack, Susan C Baker, Robert N Kirchdoerfer, Yachana Kataria, Nicholas A Crossland, Florian Douam, Mohsan Saeed

Résumé

Le variant Omicron (BA.1) du SRAS-CoV-2, récemment identifié et prédominant dans le monde, est hautement transmissible, même chez les personnes entièrement vaccinées, et provoque une maladie atténuée par rapport aux autres principaux variants viraux reconnus à ce jour. La protéine spike (S) d'Omicron, avec un nombre inhabituellement élevé de mutations, est considérée comme le principal moteur de ces phénotypes. Nous avons généré un SRAS-CoV-2 recombinant chimérique codant pour le gène S d'Omicron dans le squelette d'un isolat ancestral de SRAS-CoV-2 et avons comparé ce virus avec le variant Omicron circulant naturellement. Le virus portant le gène S d'Omicron échappe de manière robuste à l'immunité humorale induite par le vaccin, principalement en raison de mutations dans le motif de liaison du récepteur (RBM), mais, contrairement à Omicron présent dans la nature, il se réplique efficacement dans les lignées cellulaires et les cellules pulmonaires distales de type primaire. Chez les souris K18-hACE2, alors qu'Omicron provoque une infection légère et non mortelle, le virus porteur d'Omicron S inflige une maladie grave avec un taux de mortalité de 80 %. Cela indique que, si l'échappement vaccinal d'Omicron est défini par des mutations dans S, les principaux déterminants de la pathogénicité virale résident en dehors de S.

Traduction SLT