Série d'études dans les prisons fédérales faites par les CDC : Les vaccins contre la COVID-19 ne stoppent pas la charge virale - L'agence recommande des interventions non vaccinales ! (TrialSite News)

Série d'études dans les prisons fédérales faites par les CDC : Les vaccins contre la COVID-19 ne stoppent pas la charge virale - L'agence recommande des interventions non vaccinales !
Article originel : CDC Federal Prison Case Series: COVID-19 Vaccines Not Stopping Viral Loads—Agency Recommend Non-Vaccine Interventions!
TrialSite News, 5.12.22

Une équipe de chercheurs des Centers for Disease Control and Prevention (CDC), dirigée par des scientifiques de l'Epidemic Intelligence Service et des équipes d'intervention en cas de pandémie COVID-19, a cherché à mieux comprendre l'évolution dans le temps de l'excrétion virale en se basant sur l'utilisation d'outils de diagnostic tels que les valeurs de seuil de cycle (Ct) dérivées des tests de réaction en chaîne par polymérase à transcription inverse (RT-PCR) et la récupération du SRAS-CoV-2 à partir de la culture virale. À la fin, le groupe a fait valoir l'importance des interventions non vaccinales.  Le groupe a mené des recherches antérieures montrant que chez les personnes infectées par la COVID-19, elles étaient positives 1 à 2 jours avant l'apparition des symptômes et restaient positives jusqu'à 4 semaines. Pourtant, elles n'étaient capables de récupérer le virus viable que jusqu'à 10 jours après le test positif initial. Il est important de noter qu'au moment de l'apparition du variant Delta, les personnes vaccinées présentaient des valeurs Ct comparables, mais des titres viraux inférieurs à ceux des personnes non vaccinées. Cependant, ces recherches ont été menées au moment de l'apparition des symptômes ou juste après, ce qui a limité la possibilité pour les chercheurs de comprendre l'excrétion virale pendant la période pré-symptomatique. Au cours d'une épidémie de Delta, l'équipe de recherche des CDC a suivi des détenus dans une prison fédérale, testant en série cette cohorte de détenus exposés tout en documentant la chronologie de la conversion ainsi que l'excrétion virale d'au moins un certain nombre de participants, de l'exposition à l'infection et à l'apparition des symptômes. Bien que cette série de cas ait des limites importantes qui ne permettent pas nécessairement de la généraliser, les résultats sont néanmoins assez marquants. Les auteurs principaux reconnaissent que les vaccins ne fonctionnent pas dans les lieux de rassemblement pour stopper la charge virale et ils reconnaissent tous que les personnes vaccinées peuvent transmettre la maladie. Les CDC suggèrent fortement de recourir à des interventions non pharmaceutiques (y compris les vaccins) en raison de ces résultats troublants mais non surprenants.

L'étude

Dans le cadre de cette étude, les CDC se sont associés au Federal Bureau of Prisons pour enquêter sur l'épidémie de SRAS-CoV-2 Delta dans une prison fédérale du Texas. Les détenus ont été invités à participer à l'étude par écouvillonnage en série. Au moment de cette étude, environ 80 % des détenus étaient entièrement vaccinés. Du personnel formé des CDC et du BOP a été employé pour collecter tous les deux jours des écouvillons nasaux mi-turbinaux appariés pour la recherche d'antigènes et la RT-PC auprès de détenus consentants exposés pendant l'épidémie. Il est important de noter que l'étude a été approuvée par le comité d'examen des recherches du BOP et par le bureau de protection des sujets humains du CDC.

Les sujets de l'étude ont été placés en quarantaine dans la prison, tandis que les personnes dont le test était positif ont été placées en isolement médical. Le personnel de l'étude a prélevé des échantillons par écouvillonnage pendant 10 jours à compter de la date du premier test positif.  À la fin de la période de collecte de 10 jours, les sujets infectés incarcérés ont rempli un questionnaire sur les symptômes et l'ensemble des données sur les sujets comprenait les données démographiques, les antécédents médicaux, le statut vaccinal et les antécédents d'infection par le COVID-19, tous dérivés du système de dossiers électroniques de la prison fédérale.

Dans cette analyse par paires, l'équipe de l'étude a inclus au moins un test viral négatif pour le SRAS-CoV-2 avant leur premier test positif afin d'aider à établir les délais d'infection par la COVID-19. L'étude a été menée à l'aide du système REDCap (Research Electronic Data Capture) avec l'utilisation de R pour l'analyse statistique.


Résultats

Avec 12 prisonniers/sujets dans cette série de cas, l'équipe de l'étude rapporte que tous les participants étaient de sexe masculin et de couleur blanche (non hispanique) avec un âge moyen de 43 ans. Deux personnes se sont retirées de l'étude, mais l'enquête sur l'épidémie s'est terminée avant que l'équipe chargée de l'étude ne soit en mesure de collecter tous les écouvillons quotidiens pour une personne. Trois des sujets n'ont jamais eu de test antigénique positif et n'ont été écouvillonnés qu'un jour sur deux.

10 des 12 participants (83 %) ont reçu une primo-vaccination contre la COVID-19 avant l'épidémie, avec l'un des vaccins suivants :

Vaccination Product	#/%
Pfizer/BioNTech BNT162b2	4/10 40%
Moderna mRNA-1273	3/10 (30%)
Janssen JNJ-78436735

Parmi tous les sujets vaccinés, deux d'entre eux avaient une infection antérieure documentée par la COVID-19 (tous deux > 6 mois avant le début de la maladie actuelle) et tous deux ont été vaccinés.

Source: Science Direct

Dans combien de cultures virales ont-ils récupéré le SRAS-CoV-2 ?

9 sur 12 (75 %) des participants. Les auteurs de l'étude notent que les trois personnes chez qui ils n'ont pas récupéré le SRAS-CoV-2 en culture virale ont terminé leur série de primovaccination (Moderna 2/3, Janssen 1/3). Les auteurs de l'étude font état d'une durée moyenne de récupération de la COVID-19 en culture virale de 6 jours (3 à 9 jours).


Qu'en est-il de la détection de l'ARN du SRAS-CoV-2 par RT-PCR ?

Oui, ils ont détecté l'ARN du SRAS-CoV-2 chez 12 participants. L'équipe de l'étude rapporte :

"Les valeurs seuils des cycles avaient tendance à augmenter avec le nombre de jours à partir des données du premier test positif."  Ils poursuivent : "Un des 5 participants ayant obtenu au moins un résultat négatif à la RT-PCR avant le jour 10 (cas n° 8) a enregistré un résultat positif après un négatif initial."

Fait important, "les échantillons avec des résultats de culture positifs avaient des valeurs de Ct plus faibles (CT médiane=23,5, plage 16,8-32,2) que les échantillons avec des résultats de culture négatifs (médiane 31,1, plage 26,3-36,0)."

Source: Science Direct

Ventilation des résultats et implications

Tout d'abord, et c'est important, l'équipe de l'étude reconnaît qu'au cours de cette étude :

"Les personnes vaccinées et non vaccinées ont eu des résultats positifs au test RT-PCR et une récupération du virus en culture après une infection par le SRAS-CoV-2, ce qui suggère que les personnes vaccinées et non vaccinées peuvent transmettre le SRAS-CoV-2 ."

Les auteurs notent en outre que "les symptômes se développent le plus souvent après la récupération du virus viable en culture", ce qui signifie que ces résultats impliquent que la transmission peut se produire tôt après l'infection et avant l'apparition des symptômes.

Les vaccins n'ont pas eu d'incidence sur la récupération virale. Chez les 12 participants, le SRAS-CoV-2 a été retrouvé dans les cultures de l'étude jusqu'à 9 jours après l'identification du test positif, même chez les personnes vaccinées.

Autres recherches

D'autres recherches sont nécessaires pour déterminer dans quelle mesure les personnes vaccinées atteintes d'une infection par le SRAS-CoV-2 peuvent infecter d'autres personnes, dans quelle mesure les tests antigéniques peuvent être utilisés comme indicateur de l'infectiosité, et la corrélation entre l'excrétion virale et la maladie clinique chez les personnes vaccinées et non vaccinées.


Limites de cette étude

Les auteurs de l'étude signalent au moins cinq limites :

• Le variant Delta était le seul variant, et il peut être différent du variant Omicron - bien que la recherche montre que le variant Omicron est beaucoup plus transmissible que le variant Delta.   
• La petite taille de l'échantillon limite la comparaison entre les personnes vaccinées et non vaccinées. 
• Il est difficile de généraliser les résultats de cette étude.
• Il est important de noter que la récupération du SRAS-CoV-2 dans une culture virale à partir d'un écouvillon mi-turbiné peut ne pas correspondre à la transmissibilité du SRAS-CoV-2.   
• Les tests antigéniques n'ont été effectués que sur les personnes dont on sait qu'elles sont infectées, ce qui limite la capacité des auteurs de l'étude à établir une corrélation entre les résultats antigéniques et l'infectiosité.
   

Commentaires de l'équipe de l'étude

L'équipe de l'étude doit reconnaître dans cette étude " la nécessité d'interventions non pharmaceutiques telles que le masquage, la distanciation physique et les tests fréquents des personnes exposées afin d'atténuer la transmission du SRAS-CoV-2 lorsque les épidémies se produisent dans des environnements surpeuplés et à haut risque tels que les prisons ". L'équipe chargée de l'étude déclare à nouveau que "les personnes vaccinées peuvent être capables de transmettre le SRAS-CoV-2".

L'équipe chargée de l'étude reconnaît tout sauf que les personnes vaccinées peuvent transmettre la maladie, en gardant bien sûr à l'esprit les limites de l'étude.


Chercheur principal/Investigateur

Source : ResearchGate
 

    David W. McCormick, MD, CDC, Équipe de réponse à la pandémie COVID-19 ; Epidemic Intelligence Service

Note Le Dr McCormick travaille pour le Service de renseignement épidémique des CDC depuis 2020 et, auparavant, il était employé au Baylor College of Medicine.

Source : LinkedIn

    Reed Magleby, MD, CDC, Équipe de réponse à la pandémie COVID-19 ; Service de renseignement épidémique

Le Dr Magleby n'est également au CDC que depuis la pandémie. Auparavant, il était employé au NewYork-Presbyterian Hospital.

Traduction SLT

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