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Omicron : une nouvelle souche ayant fuité d'un laboratoire ?

par SLT 6 Février 2022, 05:08 Omicron Souche Laboratoire Allégations Vaccin Coronavirus Articles de Sam La Touch

 "Il est sorti de nulle part", déclare Darren Martin, biologiste informaticien à l'université du Cap, en Afrique du Sud.

Le nombre important de mutations sur le domaine codant pour la protéine Spike de la version omicron du SRARS-COV-2 laisse à penser qu'il pourrait s'agir non pas d'un variant mais bel et bien d'une nouvelle souche. Les chercheurs s'accordent à dire qu'Omicron est d'arrivée récente. Il a été détecté pour la première fois en Afrique du Sud et au Botswana au début du mois de novembre 2021 ; "depuis, des tests rétrospectifs ont permis de trouver des échantillons plus anciens provenant de personnes en Angleterre les 1er et 3 novembre, et en Afrique du Sud, au Nigeria et aux États-Unis le 2 novembre. Une analyse du taux de mutation dans des centaines de génomes séquencés et de la vitesse à laquelle le virus s'est propagé dans les populations en décembre permet de dater son apparition peu de temps avant, vers la fin septembre ou le début octobre de l'année dernière. En Afrique australe, Omicron s'est probablement propagé de la province urbaine dense de Gauteng, entre Johannesburg et Pretoria, à d'autres provinces et au Botswana voisin." (Natutre, 28.01.22)

Selon Nature, "Where did Omicron come from ?" :

"Un peu plus de deux mois après avoir été repérée en Afrique du Sud, le variant Omicron du coronavirus SRAS-CoV-2 s'est répandue dans le monde entier plus rapidement que toutes les versions précédentes. Les scientifiques ont suivi sa trace dans plus de 120 pays, mais restent perplexes face à une question clé : d'où vient Omicron ? Il n'y a pas de voie de transmission transparente reliant Omicron à ses prédécesseurs. Au lieu de cela, le variant présente un ensemble inhabituel de mutations, qui ont évolué entièrement en dehors du champ de vision des chercheurs. Omicron est si différent des variants précédents, comme Alpha et Delta, que les virologues évolutionnistes estiment que son plus proche ancêtre génétique connu remonte probablement à plus d'un an, quelque temps après la mi-2020. "Il est sorti de nulle part", déclare Darren Martin, biologiste informaticien à l'université du Cap, en Afrique du Sud."

"Une autre caractéristique curieuse d'Omicron est que, d'un point de vue génomique, il se compose de trois sous-lignées distinctes (appelées BA.1, BA.2 et BA.3) qui semblent toutes avoir émergé à peu près en même temps - deux d'entre elles ont pris leur essor au niveau mondial. Cela signifie qu'Omicron a eu le temps de se diversifier avant que les scientifiques ne le remarquent. Toute théorie sur ses origines doit prendre en compte cette caractéristique, ainsi que le nombre de mutations, note Joel Wertheim, épidémiologiste moléculaire à l'université de Californie, à San Diego."

Nature ajoutant dans cet article (cité ci-dessus) qu'il a le "génome le plus fou" qui n'ait jamais été vu : "Ce qui caractérise Omicron, c'est son nombre remarquable de mutations. Martin en a entendu parler lorsqu'il a reçu un appel téléphonique de M. de Oliveira, qui lui a demandé d'examiner le génome du SRAS-CoV-2 le plus fou qu'il ait jamais vu. Le variant présente plus de 50 mutations par rapport au virus original du SRAS-CoV-2 isolé à Wuhan, en Chine (voir go.nature.com/32utxva). Une trentaine d'entre elles contribuent à modifier les acides aminés de la protéine spike, que le coronavirus utilise pour se fixer aux cellules et fusionner avec elles. Les variantes précédentes de l'inquiétude ne comportaient pas plus de dix mutations de ce type dans la protéine spike. Cela représente un nombre considérable de modifications".

Omicron : une nouvelle souche ayant fuité d'un laboratoire ?

La question des origines d'Omicron est d'une importance plus que théorique. Déterminer dans quelles conditions cette souche hautement transmissible est apparue pourrait aider les scientifiques à comprendre le risque d'apparition de nouvelles souches. Plusieurs hypothèses ont été évoquées : Celles d'une transmission interhumaine silencieuse. Mais un certain nombre de chercheurs estiment que "le scénario selon lequel Omicron aurait évolué de manière invisible par transmission de personne à personne est "extrêmement peu plausible". Les étapes intermédiaires de l'évolution d'Omicron auraient dû être détectées dans les génomes viraux de personnes voyageant entre des pays qui font peu de séquençage et d'autres qui en font beaucoup."

 

D'autres évoquent la possiblité de mutations du virus chez une personne immunodéprimée avec une infection chronique. "De telles infections chroniques ont été observées chez des personnes dont le système immunitaire est compromis et qui ne peuvent pas se débarrasser facilement du SRAS-CoV-2. Par exemple, un rapport de cas de décembre 2020 a décrit un homme de 45 ans présentant une infection persistante5. Pendant près de cinq mois dans son hôte, le SRAS-CoV-2 a accumulé près d'une douzaine de modifications des acides aminés dans sa protéine de pointe. Certains chercheurs suggèrent qu'Alpha est apparu chez une personne atteinte d'une infection chronique, car, comme Omicron, il semble avoir accumulé des modifications à un rythme accéléré (voir go.nature.com/3yj6kmh)."

 

D'autres évoquent le passage de l'animal (notamment le rat et la souris) à l'homme mais s'interroge sur le peu de probabilité que les 3 sous-lignées distinctes aient pu effectuer ce saut pourtant extrêmement rare lorsqu'il ne s'agit que d'une sous-lignée. Alors 3 en même temps relève presque de la science fiction ?

 

La question non abordée par Nature est celle d'une origine artificielle et d'une fuiute d'un laboratoire. Dans l'hypothèse complotiste, peut-il y avoir eu une fuite d'un laboratoire d'Afrique du sud ou d'ailleurs ? On se souvient que cela avait été l'hypothèse complotiste dénoncée par les médias concernant la souche originelle du Sras-Cov-2 et qu'actuellement elle est redevenue à la mode. Qu'en est-il exactement de la nouvelle souche Omicron ?

Pour finir, voici un article de Substack publié par Eugyppius intitulé "Omicron n'est pas normal".

Omicron n'est pas normal
Article originel : Omicron is Not Normal
Par Eugyppius
Substack, 20.12.21

Omicron : une nouvelle souche ayant fuité d'un laboratoire ?

Tout porte à croire que ce variant a fuité d'un laboratoire engagé dans la recherche sur les gains de fonction.
 

Omicron n'est pas normal. On ne lui connaît aucun géniteur immédiat ; ses plus proches parents sont des virus vus pour la dernière fois entre le début et le milieu de l'année 2020. L'explication orthodoxe de ce fait gênant est qu'il a passé les 18 derniers mois à se cacher "dans une région où la surveillance génomique est faible... ou... chez un individu chroniquement infecté". L'explication la plus simple est qu'il a fui d'un laboratoire.
 

Comme el gato malo et d'autres l'ont indiqué, il est évident qu'Omicron circule préférentiellement chez les vaccinés. Selon toute vraisemblance, il s'agit du résultat d'une recherche sur le gain de fonction, au cours de laquelle le SRAS-2 a été transféré à plusieurs reprises dans du plasma de personnes convalescentes ou vaccinées, dans l'espoir d'aider le virus à échapper à l'immunité acquise. L'objectif de cette recherche serait d'anticiper les futures variantes d'évasion immunitaire que les vaccins pourraient cibler.

Omicron porte une série de mutations hautement improbables et suspectes dans sa protéine spike. Il est difficile d'imaginer que ces mutations puissent être apparues par des processus naturels, car toutes sauf une sont non synonymes - c'est-à-dire qu'elles codent pour des séquences d'acides aminés différentes. Les variants fortement mutés favorisées par la sélection naturelle devraient également présenter un grand nombre de mutations synonymes sans signification.

Les ancêtres d'Omicron ont peut-être passé un temps considérable à s'adapter aux cellules de souris, avant de réintégrer des hôtes humains. Omicron semble avoir été sélectionné pour se répliquer principalement dans le tractus bronchique. Plus profondément dans le poumon humain, il fonctionne beaucoup moins efficacement que Delta ou les premières souches de Wuhan. C'est probablement la raison pour laquelle elle provoque surtout une maladie bénigne, et cela rappelle les techniques utilisées pour rendre les vaccins vivants atténués contre la grippe plus sûrs pour l'utilisation chez l'homme. Ces vaccins sont adaptés au froid, c'est-à-dire qu'ils sont sélectionnés pour circuler principalement dans les voies respiratoires supérieures, plus froides, plutôt que dans les poumons, plus chauds et plus vulnérables.

Tout porte à croire qu'Omicron a fui d'un laboratoire engagé dans la recherche d'un vaccin contre le SRAS-2. Il y a plusieurs possibilités : Il pourrait s'agir d'un vaccin à virus vivant atténué utilisé de manière informelle par les chercheurs, qui a muté pour redevenir virulent et s'est échappé ; il pourrait avoir été libéré accidentellement ; il pourrait même s'agir d'une tentative de développer un vaccin à diffusion automatique pour immuniser les animaux ou les populations du tiers monde.

MISE À JOUR : Igor Chudov renvoie à sa propre analyse similaire du 2 décembre.

Traduction SLT avec DeepL.com

A suivre...

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