Une bombe israélienne : La protection temporelle négligeable du vaccin à ARNm de Pfizer contre la transmission virale : Suggère une réévaluation des futures campagnes de rappel
Article originel : Israeli Bombshell: Negligible Temporal Protection of Pfizer mRNA Vaccine Against Viral Transmission: Suggest Reassessment of Future Booster Campaigns
TrialSite News, 10.11.22
Des chercheurs israéliens, représentés par l'auteur correspondant, Naama M. Kopelman, du département d'informatique de l'Institut de technologie de Holon, et des scientifiques des départements de microbiologie clinique et d'épidémiologie du Sheba Medical Center, ont mené une étude rétrospective combinant les données nationales de vaccination à l'échelle de la population et les données Ct (NdT : seuil de cycle d'amplification en chaîne par polymérse PCR qui permet d'estimer la charge virale et donc l'nfectiosité) provenant de quatre grands laboratoires israéliens effectuant des tests PCR sur le SRAS-CoV-2, dans le but de mesurer non seulement l'efficacité du vaccin (habituellement mesurée par la protection contre l'infection, la maladie clinique ou le décès), mais aussi le risque potentiel de transmission de l'infection. Ce dernier élément, souvent négligé lors de l'étude COVID-19, représente pourtant un sujet sérieux de préoccupation pour les politiques de santé publique et la réduction de la propagation virale. Dans cette étude, l'impressionnante équipe de scientifiques s'est penchée sur l'importante mesure du risque de transmission en tenant compte de la charge virale, qui présente une corrélation négative avec les valeurs de seuil de cycle (Ct) dans l'amplification en chaîne par polymérase en temps réel (qRT-PCR). Un substitut facilement disponible pour estimer l'infectiosité - les valeurs de Ct associées aux tests PCR du SRAS-CoV-2 - a servi de base à cette étude rétrospective comparant les niveaux de Ct de personnes en Israël vaccinées avec 2, 3 ou 4 doses à ceux de personnes ayant récupéré de la COVID-19. Les résultats rapportés sont troublants. En dépit des limites reconnues, les résultats soulèvent des questions imminentes sur toute campagne de rappel à l'avenir. En mettant l'accent sur le vaccin à ARNm produit par Pfizer-BioNTech (BNT162b2), l'équipe rapporte que, qu'il s'agisse de la série primaire à deux doses, de la troisième dose de rappel (pendant Delta ou Omicron) ou de la quatrième dose pour les personnes âgées et à risque, la durée du bénéfice, considérée comme une protection contre la transmission virale, est de courte durée. Compte tenu de l'énormité des dépenses publiques, cette performance appelle à la nécessité de réévaluer l'avenir des campagnes de rappel.
Contexte
Kopelman et ses collègues établissent d'abord que, d'après les données disponibles sur les études menées pendant le variant Delta, les personnes vaccinées ont été enregistrées comme ayant un Ct plus élevé (c'est-à-dire une charge virale plus faible), ce qui signifie qu'elles étaient moins infectieuses, et que cet effet s'estompe au fil du temps.
Dans cette étude innovante, les chercheurs ont cherché à compléter les preuves en évaluant le Ct d'Omicron par rapport aux statuts de vaccination et de guérison : dans ce contexte, comment le Ct évolue-t-il avec le temps depuis la vaccination/l'infection, sur la base de riches données nationales de qRT-PCR. Les auteurs soulignent que "l'effet décroissant de la protection induite par l'infection n'a pas été analysé en profondeur auparavant en termes de Ct et d'infectiosité."
Appliqué à Israël
Les auteurs de l'étude expliquent la campagne de vaccination de masse en Israël. Le tableau ci-dessous met en évidence les trois principales étapes de ce processus, à partir du 19 décembre 2020.
Répartition de l'étude
TrialSite présente une brève analyse des résultats de cette importante étude. Il est important de noter que cette équipe d'étude a cherché à mesurer l'efficacité réelle du vaccin en fonction de la transmissibilité. Ce facteur a évidemment "des implications majeures pour les politiques de santé publique".
Quelle est l'hypothèse de base de cette étude ?
La valeur Ct est un substitut courant de la charge virale (VL) et de l'infectiosité.
D'où proviennent les données Ct ?
Quatre laboratoires moléculaires, dont deux de l'Israeli Health Maintenance Organization représentant environ 40 % de la population israélienne et deux laboratoires accrédités par le ministère israélien de la santé (MoH). Les tests PCR sont associés au programme de surveillance de masse du MoH.
Quelles données ont été analysées ?
Les données des tests PCR associés aux tests effectués du 15 juin 20221 au 29 janvier 2022, ce qui inclut deux périodes de poussée Delta et Omicron, ont été analysées. L'étude comprenait de nombreuses catégories de données, notamment le statut vaccinal, le laboratoire, l'âge, le sexe et le temps calendaire (tranches de 7 jours) comme covariables. Le statut vaccinal a été défini comme suit : non vacciné, 2 doses (divisées en 3 tranches, 10-39 jours, 40-69, >70 jours post-vaccination), 3 doses (divisées en 3 tranches, 10-39, 40-69, >70 jours), 4 doses, ou personnes guéries n'ayant reçu aucune vaccination entre les deux événements infectieux. La figure 1 illustre les valeurs de Ct ajustées pour Delta et Omicron. En raison du petit nombre d'individus dans les groupes à 2 doses (précoces) pour la période Omicron, tous les groupes à 2 doses ont été combinés.
Comment ont-ils analysé les données ?
Exploitant les riches données organisées par protocole, ils ont effectué une analyse de régression linéaire multivariée sur les valeurs de Ct appliquées aux variants delta et omicron, le statut vaccinal et de nombreux autres éléments de données.
Quels sont les résultats ?
Les auteurs rapportent qu'en ce qui concerne la poussée Delta, une série primaire (2 doses) "diminue sensiblement la charge virale, ce qui est clairement mis en évidence par la diminution entre le niveau de Ct non vacciné et celui de la 2-dose précoce (10-39 jours)".
La cohorte de vaccins à 2 doses a démontré son succès avec une mesure de 1,54 unité Ct supérieure à celle des personnes non vaccinées, ce qui a entraîné une diminution par trois de la charge virale. Mais cela n'a pas duré longtemps. Selon les auteurs de l'étude, "la protection diminue rapidement à mesure que le temps s'écoule depuis la vaccination, et le Ct atteint un niveau similaire à celui des personnes non vaccinées au 70e jour."
Qu'en est-il de la cohorte ayant reçu trois doses de vaccin ? Ce groupe présente un pic de protection encore plus élevé, mais "une fois de plus, la protection s'estompe rapidement, et au 70e jour, Ct atteint le niveau de base des personnes non vaccinées".
Et pour Omicron ? Une troisième dose de rappel fait grimper le Ct chez les vaccinés et est comparable à la protection dérivée de l'infection. Cependant, les auteurs soulignent que "les différences de Ct pour les groupes non vaccinés (Ct ajusté 25,9), 2 doses (Ct ajusté 25,7) et 3 doses tardives (Ct ajusté 25,8) sont négligeables."
Les auteurs poursuivent :
"En général, l'effet du statut immunitaire pour Omicron est moins prononcé que pour Delta, même en cas de réception récente de la 3e dose de vaccin ou d'une infection antérieure, comme le montre la réduction des écarts de valeurs Ct entre ces groupes et les non-vaccinés. La différence relative entre les personnes récemment vaccinées (3 doses, 10-39 jours) et les personnes non vaccinées est plus faible dans Omicron (0,97, IC 95 % 0,78-1,16) que dans Delta (1,92, IC 95 % 1,71-2,13). De même, l'écart relatif entre les personnes guéries et les personnes non vaccinées est de 1,69 (IC 95 % 1,49-1,88) dans Delta, alors qu'il est réduit à 0,78 (IC 95 %, 0,68-0,88) dans Omicron. Ces écarts sont réduits du simple au double dans Omicron, peut-être en raison de l'affaiblissement du système immunitaire de l'hôte et de l'évasion virale."
Qu'en est-il de la 4e dose de rappel ?
Là encore, elle a été administrée principalement à des personnes âgées, ce qui nécessite une analyse distincte. Dans la figure 2, les auteurs signalent que "peu de temps" après l'administration de la 4e dose, "le Ct des individus vaccinés (âgés de plus de 60 ans) atteint des niveaux similaires à ceux des individus guéris, et significativement plus élevés que ceux des individus non vaccinés, ayant reçu les 2e et 3e doses, du même groupe d'âge, ce qui indique au moins une efficacité à court terme du vaccin dans la réduction du niveau de Ct".
Au moins pendant un mois, la quatrième dose a effectivement offert une protection contre "l'infection confirmée et la maladie grave", mais la durée de cette protection est de courte durée.
Quelles sont les implications des résultats de l'étude ?
Sur la base de cette analyse d'un ensemble complet de données nationales, les chercheurs israéliens constatent que "globalement, l'immunité présumée liée à la vaccination contre le SRAS-CoV-2 n'a qu'un effet négligeable à long terme (>70 jours) sur la valeur du Ct". Encore une fois, le substitut utilisé pour la charge virale et l'infectiosité, les chercheurs israéliens rappellent que "la combinaison de l'affaiblissement du vaccin et de l'évasion vaccinale sont les facteurs les plus probables de ce résultat."
Ils poursuivent :
"Cette étude impose de réévaluer le rôle des campagnes de vaccination actuelles dans l'exploitation de l'infectiosité potentielle de la COVID-19 à une échelle de temps >2 mois."
En outre, les décideurs doivent trouver un équilibre entre les éléments suivants :
- L'utilisation judicieuse des ressources en vaccins
- Diminution de la charge de morbidité, notamment dans les populations à haut risque
- Fausse réassurance et comportement de promiscuité en raison de la courte durée de l'immunité stérilisante.
Sinon, selon les auteurs, ces facteurs "peuvent faire en sorte que les campagnes de vaccination soient considérées comme des mesures de restriction épidémiologique contre-productives sans communication appropriée avec le public."
Quelle est la principale conclusion des auteurs ?
Un facteur clé dans l'évaluation de l'engagement de temps, de capital et de ressources pour les futurs programmes de vaccins de rappel doit tenir compte de détails tels que les niveaux de prévention et de réduction de la transmission, l'évaluation de la durabilité de la protection, la gravité de la maladie ainsi que la mortalité.
Limites
- Bien que l'efficacité de la PCR soit probablement comparable pour les variants Delta et Omicron, les auteurs suggèrent de faire preuve de prudence dans la comparaison des valeurs de Ct entre les variants, et de se concentrer plutôt sur les comparaisons intra-variants.
- Les normes spécifiques des laboratoires peuvent limiter les résultats des valeurs Ct
- Des biais temporels sont possibles en raison de l'évolution des politiques et des comportements en matière de santé.
Naama M. Kopelman, PhD
Source : Institut de technologie de Holon
Chercheur principal/Investigateur
- Naama M. Kopelman, PhD Maître de conférences, directeur du département d'informatique, Holon Institute of Technology, Holon, Israël, auteur correspondant.
- Yonatan Woodbridge, Institut Gertner d'épidémiologie et de recherche sur les politiques de santé, Centre médical Sheba, Ramat Gan, Israël ; Département d'informatique, Institut de technologie de Holon, Holon, Israël.
- Sharon Amit, MD, PhD Directrice, Microbiologie clinique, Centre médical Sheba, Ramat Gan, Israël
- Amit Huppert, PhD Institut Gertner d'épidémiologie et de recherche sur les politiques de santé, Centre médical Sheba, Ramat Gan, Israël ; Faculté de médecine Sackler, Université de Tel-Aviv, Tel-Aviv, Israël.
Traduction SLT